持票人申请银行承兑汇票贴现时，贴现人会根据银行承兑汇票贴现率收取一定贴息。银行承兑汇票贴现率表示贴息额与票面金额间的比率，通常用百分比表示，按年计算则称为年利率。银行承兑汇票贴现率（年利率）= 贴现利息/票面金额*360/贴现天数

银行承兑汇票贴现率市场化程度很高，其定价高低受票据经营机构内、外部因素影响。

影响票据经营机构银行承兑汇票贴现率定价的内部主要因素有该机构经营策略、资金状况、资金成本及盈利目标。利用某商业银行资金富裕时，可以降低银行承兑汇票贴现率以购入票据，增加银行承兑汇票持有量；资金紧缺时，提高银行承兑汇票贴现率，减少票据持有量，从而维持盈利目标。

影响票据经营机构银行承兑汇票贴现率定价的外部定价主要因素有银行承兑汇票再贴现率、同业拆借市场和债券回购市场利率水平、市场同类产品价格水平、银行承兑汇票贴现期限和银行承兑汇票出票行信用状况等。例如，再贴现率作为银行承兑汇票贴现利率的定价基础，影响商业银行的融资成本和融资方式，再贴现率的调整直接影响银行承兑汇票贴现率。2008年11月27日，中国人民银行将再贴现利率从4.32%降至2.97%，直接导致各票据经营机构银行承兑汇票贴现率大幅下调。

正是由于银行承兑汇票贴现率受到商业银行内部因素影响，所以各银行之间银行承兑贴现率会有较大的差别银行承兑汇票贴现率高低对贴现申请人的贴现成本有很大影响，1000万三个月到期的银行承兑汇票，银行承兑汇票贴现率相差0.1‰，贴息就相差3000元。